Der Vorstand des Freien Kindergarten Jena e.V. wird jährlich auf der Vollversammlung des Vereins gewählt.
Die letzte Vorstandswahl fand am 17.09.2025 statt. Es wurden folgende Mitglieder gewählt:
- Franziska Geinitz
- Fabian Hachenberg
- Dr. rer. nat. Benjamin Kintzel
- Dr. rer. nat. Ralf Labouvie
- Dr. Ing. Juliane Brandt-Slowik
- Susanne Tschirschwitz
- Alexander Zakosarenko